实时荧光定量PCR( realtime fluores-cence quantitative PCR,RT-qPCR ),是通过荧光染料或荧光标记的特异性的探针,对PCR产物进行标记跟踪,实时在线监控反应过程,结合相应的软件可以对产物进行分析,计算待测样品模板的初始浓度。由于荧光定量PCR具有高特异度、高灵敏度、高重复性,是科研、疾病诊断常用技术手段。
一、技术路线
二、技术方法
2.1 样本基因组提取
2.1.1RNA提取
- 所需样本量:细胞(≥106)、组织(≥300mg)、血液(≥2ml)、血清(≥1.5ml)等样品材料,总RNA(≥20μl,浓度≥ 50ng/μl)。
- 样本保存:组织样本请保存在-80ºC或保存在Trizol中(液氮研磨后)或保存在RNAlater中(动物组织)
- 样品运输:用冻存管保存,并用干冰或液氮运输。
相关技术服务 | |
服务项目 | 内容说明 |
RNA提取 | 从血液、组织、叶片等样本材料中提取总RNA |
血清RNA提取 | 从1-5ml血清中提取总RNA |
石蜡包埋组织RNA提取 | 从石蜡包埋的组织块中提取总RNA |
- 所需样本量:细胞(≥106)、组织(≥300mg)、血液(≥2ml)、血清(≥1.5ml)等样品材料,总DNA(≥20μl,浓度≥ 50ng/μl);
- 样本保存:组织样本请保存在-80ºC;
- 样品运输:用冻存管保存,并用干冰或液氮运输。
相关技术服务 | |
服务项目 | 内容说明 |
DNA提取 | 从血液、组织、叶片等样本材料中提取总DNA |
血清DNA提取 | 从1-5ml血清中提取总DNA |
石蜡包埋组织DNA提取 | 从石蜡包埋的组织块中提取总DNA |
如果客户给的样本是已提取好的总RNA样本,需满足以下条件:
- 完整性:1.2%琼脂糖凝胶电泳出现两条带(28s、18s RNA),其中28s RNA条带的亮度是18s RNA条带亮度的1.5~2.0倍,否则说明RNA出现了降解。如果出现弥散片状或者条带缺失,则说明RNA样本出现严重降解,说明样本不可用;
- 纯度:OD260/OD280在1.8~2.1之间,比值最好为2.0(保存液为pH=7.0 的RNase free ddH2O)。DNA 应该去除干净;
- 浓度:最低浓度不低于200ng/μl,每个样品总量不少于10μg;
- 保存条件:要溶解在H20或TE (pH 8.0),用冻存管保存,并用干冰或液氮运输;。
2.1.3原则性要求
(1)请提供新鲜材料,总量越多越好;
(2)请提供已知的全长基因序列;
(3)请提供尽可能详细的背景资料,如DNA/RNA来源等。
2.2反转录
mRNA的cDNA第一链合成方法:
- 普通RNA模板
- 二级结构复杂的RNA模板(由我公司技术工程师鉴定)
- SYBR Green I法
- Taqman探针法
- 相对定量
- 绝对定量
- 分析点突变和等位基因
- DNA甲基化检测
- 单核苷酸多态性(SNP)分析
三、实时荧光定量平台及参考报价
实时荧光定量平台 | 服务内容 | 价格 |
样本抽提 | 抽提RNA | 70元/样 |
抽提DNA | 50元/样 | |
引物、Taqman探针设计及合成 | 引物设计及合成 | 100元/基因 |
Taqman探针设计及合成 | 1000元/基因 | |
逆转录 | RNA反转录成cDNA | 50元/样 |
预实验(荧光定量体系优化) | 确定荧光定量PCR最优条件 | 300元/基因 |
标准品制作 | 绝对定量分析必须制备 | 500元/基因 |
荧光定量检测 | 目的基因、内参基因 | 50元/反应 |
实验数据分析 | 分析实验数据,得出结论 | 免费 |
四、完成时间
2个星期,(视样本量大小而定)
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