一、SILAC研究蛋白质相互作用概述
用SILAC (Stable isotope labeling with amino acids in cell culture,SILAC) 寻找相互作用蛋白是SILAC在定量蛋白质组学研究基础上的进一步应用。其基本原理是通过质谱鉴定和分析蛋白质相对量来判断是否是特异性结合诱饵蛋白,当实验组与对照组中某个蛋白质量含量达到统计学的差异时,就判定这个蛋白质与诱饵蛋白质具有相互作用。
用SILAC (Stable isotope labeling with amino acids in cell culture,SILAC) 寻找相互作用蛋白是SILAC在定量蛋白质组学研究基础上的进一步应用。其基本原理是通过质谱鉴定和分析蛋白质相对量来判断是否是特异性结合诱饵蛋白,当实验组与对照组中某个蛋白质量含量达到统计学的差异时,就判定这个蛋白质与诱饵蛋白质具有相互作用。
二、与传统的CoIP或Pull down相比,SILAC技术研究蛋白质相互作用具有以下优势
1、特异性强,假阳性极低;
2、高通量,液相与质谱连用,能最大限度的寻找到相互作用的蛋白质;
3、灵敏度高。
1、特异性强,假阳性极低;
2、高通量,液相与质谱连用,能最大限度的寻找到相互作用的蛋白质;
3、灵敏度高。
三、SILAC研究蛋白质相互作用技术服务流程
图1:基于SILAC法研究蛋白质间的相互作用。1.分别用轻链、重链氨基酸培养细胞并提取蛋白质;2. 轻链、重链蛋白分别用Nomal IgG和特异抗体做IP;3.混合轻链、重链IP产物,SDS-page分离;4.胶内酶切,肽段抽提、纯化、鉴定和定量。
四、SILAC研究蛋白质相互作用结果简要说明
图2:SI LAC分析蛋白质相互作用的质谱峰图及被鉴定蛋白的生物信息分析。
五、SILAC研究蛋白质相互作用技术服务内容
1、细胞同位素标记;(本公司出售L、M、H型Lys和Arg)
2、样本制备与定量;
3、SDS-PAGE分离后液相分离和质谱分析;
4、数据库检索;相互作用蛋白分析;
1、细胞同位素标记;(本公司出售L、M、H型Lys和Arg)
2、样本制备与定量;
3、SDS-PAGE分离后液相分离和质谱分析;
4、数据库检索;相互作用蛋白分析;
5、相互作用蛋白的生物信息分析
6、实验报告提交。
6、实验报告提交。
六、送样须知
1、技术服务咨询:在您开始实验之前,本公司将为竭诚您提供给类科学、严谨的SILACIP实验设计方案。
2、为了保证SILAC实验能顺利进行,样品寄送需满足以下要求:
基本要求:SILAC只适合标记可在SILAC培养基中培养的细胞、细菌等材料,对于组织、体液、及一些不能在SILAC培养基中培养的细胞不能用SILAC法标记,具体情况请咨询辉骏生物。
运输要求:液氮或干冰保存寄送,广州本地客户可上门收样。
注:样本应避免各类污染和反复冻融。
2、为了保证SILAC实验能顺利进行,样品寄送需满足以下要求:
基本要求:SILAC只适合标记可在SILAC培养基中培养的细胞、细菌等材料,对于组织、体液、及一些不能在SILAC培养基中培养的细胞不能用SILAC法标记,具体情况请咨询辉骏生物。
运输要求:液氮或干冰保存寄送,广州本地客户可上门收样。
注:样本应避免各类污染和反复冻融。
七、实验服务报告内容
1、蛋白定鉴定;
2、SILAC鉴定相互作用蛋白质的分析结果;
3、顾客指定蛋白质对应的质谱峰图;
4、完整的技术服务报告,包括实验步骤、使用试剂、仪器、软件检索参数等。
1、蛋白定鉴定;
2、SILAC鉴定相互作用蛋白质的分析结果;
3、顾客指定蛋白质对应的质谱峰图;
4、完整的技术服务报告,包括实验步骤、使用试剂、仪器、软件检索参数等。
八、实验服务周期及收费标准:咨询本公司
九、质量承诺
1、严谨的SILAC技术服务方案确保结果可靠;
2、提供SILAC相互作用蛋白质分析结果。
1、严谨的SILAC技术服务方案确保结果可靠;
2、提供SILAC相互作用蛋白质分析结果。