凝素亲和法是目前糖蛋白质组学中应用广泛的分离富集方法。凝集素(lectin)是一类糖结合蛋白质,能专一识别某一特殊结构的单糖或聚糖中特定的糖基序列而与之结合,它们与糖链可逆非共价结合,糖蛋白或糖肽被凝集素捕获之后,通常用特定的单糖通过竞争结合凝集素将糖蛋白或糖肽洗脱下来。蛋白质经过酶解后利用凝集素(lectin)富集N-糖基化肽段,然后用N-糖酰胺酶(PNGase)在H218O中切除连接在天冬酰胺残基(Asn)上的糖链。该处理致使Asn分子量增加2.9890Da。最后用高精度LC-MS质谱仪检测脱糖后的肽段,并通过MASCOT软件检索数据库,确认脱糖后分子量与其理论分子量的变化以及糖基化修饰肽段的序列,从而确定该蛋白质的N-糖基化位点。
技术路线
技术平台
Triple TOF 5600, Q-Exactive, Orbitrap Fusion™ Tribrid™
样品要求
-
SDS-PAGE条带:5个以上可见考染条带。
-
溶液(目标蛋白质):目标蛋白总量>50μg,目标蛋白浓度>80%。
-
溶液(大规模混合蛋白质):蛋白总量>1mg,蛋白浓度>1μg/μl